Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp4P35123 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp4P35123 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp4P35123 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp4P35123 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp4P35123 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp4P35123 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp4P35123 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp4P35123 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp4P35123 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp4P35123 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp4P35123 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp4P35123 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp4P35123 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp4P35123 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp4P35123 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp4P35123 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp4P35123 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp4P35123 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp4P35123 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp4P35123 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp4P35123 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp4P35123 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp4P35123 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp4P35123 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp4P35123 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp4P35123 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp4P35123 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp4P35123 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp4P35123 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp4P35123 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp4P35123 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp4P35123 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp4P35123 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp4P35123 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp4P35123 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp4P35123 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp4P35123 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp4P35123 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp4P35123 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp4P35123 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp4P35123 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp4P35123 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp4P35123 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp4P35123 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp4P35123 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp4P35123 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp4P35123 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp4P35123 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp4P35123 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp4P35123 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp4P35123 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp4P35123 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp4P35123 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp4P35123 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp4P35123 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp4P35123 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp4P35123 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp4P35123 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp4P35123 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp4P35123 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp4P35123 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp4P35123 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp4P35123 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp4P35123 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp4P35123 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp4P35123 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp4P35123 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp4P35123 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp4P35123 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp4P35123 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp4P35123 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp4P35123 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp4P35123 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp4P35123 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp4P35123 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp4P35123 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp4P35123 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp4P35123 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp4P35123 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp4P35123 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp4P35123 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp4P35123 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp4P35123 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp4P35123 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp4P35123 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp4P35123 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp4P35123 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp4P35123 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp4P35123 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp4P35123 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp4P35123 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp4P35123 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp4P35123 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp4P35123 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp4P35123 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp4P35123 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp4P35123 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp4P35123 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp4P35123 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms