Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Casp1P29452 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Casp1P29452 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Casp1P29452 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Casp1P29452 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Casp1P29452 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Casp1P29452 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Casp1P29452 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Casp1P29452 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Casp1P29452 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms