Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BgnP28653 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BgnP28653 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BgnP28653 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BgnP28653 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BgnP28653 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BgnP28653 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
BgnP28653 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BgnP28653 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BgnP28653 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BgnP28653 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BgnP28653 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BgnP28653 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BgnP28653 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BgnP28653 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BgnP28653 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BgnP28653 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BgnP28653 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BgnP28653 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BgnP28653 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BgnP28653 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
BgnP28653 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
BgnP28653 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BgnP28653 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BgnP28653 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BgnP28653 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BgnP28653 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BgnP28653 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BgnP28653 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BgnP28653 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BgnP28653 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
BgnP28653 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BgnP28653 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BgnP28653 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BgnP28653 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BgnP28653 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BgnP28653 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BgnP28653 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BgnP28653 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BgnP28653 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BgnP28653 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BgnP28653 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BgnP28653 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BgnP28653 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BgnP28653 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BgnP28653 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BgnP28653 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
BgnP28653 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BgnP28653 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BgnP28653 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BgnP28653 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BgnP28653 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BgnP28653 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BgnP28653 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BgnP28653 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BgnP28653 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BgnP28653 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BgnP28653 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BgnP28653 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BgnP28653 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BgnP28653 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BgnP28653 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BgnP28653 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BgnP28653 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
BgnP28653 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BgnP28653 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BgnP28653 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BgnP28653 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BgnP28653 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BgnP28653 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
BgnP28653 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BgnP28653 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BgnP28653 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BgnP28653 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BgnP28653 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BgnP28653 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BgnP28653 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BgnP28653 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BgnP28653 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
BgnP28653 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BgnP28653 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BgnP28653 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BgnP28653 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BgnP28653 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BgnP28653 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BgnP28653 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BgnP28653 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BgnP28653 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BgnP28653 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BgnP28653 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BgnP28653 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BgnP28653 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BgnP28653 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BgnP28653 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BgnP28653 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BgnP28653 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BgnP28653 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BgnP28653 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BgnP28653 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BgnP28653 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms