Protein–RNA interactions for Protein: P28322

Etv4, ETS translocation variant 4, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv4P28322 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Etv4P28322 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Etv4P28322 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Etv4P28322 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Etv4P28322 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Etv4P28322 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Etv4P28322 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Etv4P28322 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Etv4P28322 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Etv4P28322 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Etv4P28322 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Etv4P28322 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms