Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LoxP28301 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LoxP28301 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LoxP28301 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LoxP28301 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LoxP28301 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LoxP28301 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LoxP28301 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LoxP28301 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LoxP28301 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LoxP28301 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LoxP28301 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LoxP28301 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LoxP28301 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LoxP28301 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LoxP28301 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LoxP28301 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LoxP28301 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LoxP28301 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LoxP28301 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LoxP28301 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LoxP28301 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LoxP28301 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LoxP28301 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LoxP28301 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LoxP28301 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LoxP28301 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LoxP28301 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LoxP28301 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LoxP28301 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LoxP28301 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LoxP28301 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LoxP28301 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LoxP28301 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LoxP28301 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LoxP28301 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LoxP28301 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LoxP28301 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LoxP28301 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LoxP28301 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LoxP28301 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LoxP28301 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LoxP28301 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LoxP28301 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LoxP28301 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LoxP28301 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LoxP28301 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LoxP28301 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LoxP28301 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LoxP28301 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LoxP28301 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LoxP28301 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LoxP28301 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LoxP28301 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LoxP28301 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LoxP28301 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LoxP28301 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LoxP28301 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LoxP28301 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LoxP28301 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LoxP28301 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LoxP28301 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LoxP28301 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LoxP28301 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LoxP28301 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LoxP28301 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LoxP28301 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LoxP28301 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LoxP28301 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LoxP28301 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LoxP28301 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LoxP28301 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LoxP28301 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LoxP28301 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LoxP28301 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LoxP28301 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LoxP28301 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LoxP28301 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LoxP28301 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LoxP28301 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LoxP28301 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LoxP28301 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LoxP28301 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LoxP28301 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LoxP28301 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LoxP28301 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LoxP28301 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LoxP28301 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LoxP28301 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LoxP28301 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LoxP28301 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LoxP28301 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LoxP28301 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LoxP28301 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LoxP28301 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LoxP28301 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LoxP28301 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LoxP28301 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LoxP28301 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LoxP28301 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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