Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb9P28076 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb9P28076 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms