Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2afxP27661 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2afxP27661 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2afxP27661 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2afxP27661 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms