Protein–RNA interactions for Protein: P25318

Col8a2, Collagen alpha-2(VIII) chain, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col8a2P25318 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col8a2P25318 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col8a2P25318 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col8a2P25318 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Col8a2P25318 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col8a2P25318 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col8a2P25318 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col8a2P25318 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col8a2P25318 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col8a2P25318 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col8a2P25318 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col8a2P25318 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col8a2P25318 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col8a2P25318 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col8a2P25318 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col8a2P25318 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col8a2P25318 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col8a2P25318 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Col8a2P25318 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col8a2P25318 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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