Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prim1P20664 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prim1P20664 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prim1P20664 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prim1P20664 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prim1P20664 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prim1P20664 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prim1P20664 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prim1P20664 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Prim1P20664 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prim1P20664 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prim1P20664 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prim1P20664 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prim1P20664 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prim1P20664 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159.6 ms