Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VimP20152 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VimP20152 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VimP20152 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VimP20152 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VimP20152 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VimP20152 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VimP20152 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VimP20152 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VimP20152 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VimP20152 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VimP20152 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VimP20152 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VimP20152 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VimP20152 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
VimP20152 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VimP20152 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VimP20152 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VimP20152 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VimP20152 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
VimP20152 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VimP20152 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VimP20152 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VimP20152 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VimP20152 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VimP20152 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VimP20152 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VimP20152 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VimP20152 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VimP20152 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VimP20152 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VimP20152 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VimP20152 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VimP20152 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VimP20152 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VimP20152 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VimP20152 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VimP20152 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VimP20152 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VimP20152 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VimP20152 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VimP20152 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VimP20152 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VimP20152 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VimP20152 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VimP20152 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VimP20152 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VimP20152 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VimP20152 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VimP20152 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VimP20152 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VimP20152 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VimP20152 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
VimP20152 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VimP20152 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VimP20152 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VimP20152 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VimP20152 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VimP20152 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VimP20152 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VimP20152 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VimP20152 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VimP20152 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VimP20152 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
VimP20152 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VimP20152 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VimP20152 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VimP20152 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VimP20152 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VimP20152 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VimP20152 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VimP20152 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VimP20152 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
VimP20152 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VimP20152 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VimP20152 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VimP20152 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VimP20152 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VimP20152 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VimP20152 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VimP20152 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VimP20152 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VimP20152 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VimP20152 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VimP20152 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VimP20152 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VimP20152 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
VimP20152 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VimP20152 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VimP20152 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VimP20152 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VimP20152 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VimP20152 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VimP20152 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VimP20152 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VimP20152 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VimP20152 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VimP20152 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VimP20152 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VimP20152 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms