Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ms4a1P19437 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms