Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

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Length 1,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NefhP19246 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NefhP19246 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NefhP19246 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NefhP19246 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NefhP19246 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NefhP19246 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NefhP19246 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NefhP19246 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NefhP19246 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NefhP19246 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NefhP19246 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
NefhP19246 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NefhP19246 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NefhP19246 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NefhP19246 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NefhP19246 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NefhP19246 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NefhP19246 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NefhP19246 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NefhP19246 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NefhP19246 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NefhP19246 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NefhP19246 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NefhP19246 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NefhP19246 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NefhP19246 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NefhP19246 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NefhP19246 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NefhP19246 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NefhP19246 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NefhP19246 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NefhP19246 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NefhP19246 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NefhP19246 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NefhP19246 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NefhP19246 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NefhP19246 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NefhP19246 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NefhP19246 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NefhP19246 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NefhP19246 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NefhP19246 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NefhP19246 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NefhP19246 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NefhP19246 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NefhP19246 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NefhP19246 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NefhP19246 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NefhP19246 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NefhP19246 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NefhP19246 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NefhP19246 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NefhP19246 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NefhP19246 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NefhP19246 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NefhP19246 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NefhP19246 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NefhP19246 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NefhP19246 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NefhP19246 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NefhP19246 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NefhP19246 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NefhP19246 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NefhP19246 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NefhP19246 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NefhP19246 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NefhP19246 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NefhP19246 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NefhP19246 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NefhP19246 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NefhP19246 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NefhP19246 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NefhP19246 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NefhP19246 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NefhP19246 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NefhP19246 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NefhP19246 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NefhP19246 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NefhP19246 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NefhP19246 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NefhP19246 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NefhP19246 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NefhP19246 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NefhP19246 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NefhP19246 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NefhP19246 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NefhP19246 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NefhP19246 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NefhP19246 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NefhP19246 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NefhP19246 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NefhP19246 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NefhP19246 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NefhP19246 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NefhP19246 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NefhP19246 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NefhP19246 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NefhP19246 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NefhP19246 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
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