Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka3P18654 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka3P18654 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka3P18654 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka3P18654 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka3P18654 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka3P18654 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka3P18654 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka3P18654 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka3P18654 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka3P18654 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka3P18654 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka3P18654 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka3P18654 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka3P18654 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka3P18654 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps6ka3P18654 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps6ka3P18654 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps6ka3P18654 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps6ka3P18654 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps6ka3P18654 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps6ka3P18654 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps6ka3P18654 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps6ka3P18654 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps6ka3P18654 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps6ka3P18654 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps6ka3P18654 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps6ka3P18654 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps6ka3P18654 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps6ka3P18654 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps6ka3P18654 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps6ka3P18654 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps6ka3P18654 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps6ka3P18654 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps6ka3P18654 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps6ka3P18654 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps6ka3P18654 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps6ka3P18654 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps6ka3P18654 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps6ka3P18654 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps6ka3P18654 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps6ka3P18654 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps6ka3P18654 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps6ka3P18654 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps6ka3P18654 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps6ka3P18654 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps6ka3P18654 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps6ka3P18654 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps6ka3P18654 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps6ka3P18654 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps6ka3P18654 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps6ka3P18654 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms