Protein–RNA interactions for Protein: P15499

Prph2, Peripherin-2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prph2P15499 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prph2P15499 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prph2P15499 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prph2P15499 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prph2P15499 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prph2P15499 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prph2P15499 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prph2P15499 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prph2P15499 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prph2P15499 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prph2P15499 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prph2P15499 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prph2P15499 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms