Protein–RNA interactions for Protein: P13504

Il1r1, Interleukin-1 receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il1r1P13504 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Il1r1P13504 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Il1r1P13504 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Il1r1P13504 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Il1r1P13504 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Il1r1P13504 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Il1r1P13504 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Il1r1P13504 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Il1r1P13504 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Il1r1P13504 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Il1r1P13504 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Il1r1P13504 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Il1r1P13504 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Il1r1P13504 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Il1r1P13504 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Il1r1P13504 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Il1r1P13504 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Il1r1P13504 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Il1r1P13504 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Il1r1P13504 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Il1r1P13504 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Il1r1P13504 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Il1r1P13504 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Il1r1P13504 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms