Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vpreb2P13373 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vpreb2P13373 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms