Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Chrm1P12657 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Chrm1P12657 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrm1P12657 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrm1P12657 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrm1P12657 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrm1P12657 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrm1P12657 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrm1P12657 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrm1P12657 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrm1P12657 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrm1P12657 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrm1P12657 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrm1P12657 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrm1P12657 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrm1P12657 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrm1P12657 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrm1P12657 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrm1P12657 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrm1P12657 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrm1P12657 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrm1P12657 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrm1P12657 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chrm1P12657 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chrm1P12657 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chrm1P12657 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chrm1P12657 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chrm1P12657 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chrm1P12657 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chrm1P12657 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Chrm1P12657 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chrm1P12657 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Chrm1P12657 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Chrm1P12657 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chrm1P12657 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chrm1P12657 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chrm1P12657 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms