Protein–RNA interactions for Protein: P11609

Cd1d1, Antigen-presenting glycoprotein CD1d1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd1d1P11609 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd1d1P11609 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cd1d1P11609 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cd1d1P11609 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cd1d1P11609 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd1d1P11609 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd1d1P11609 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd1d1P11609 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd1d1P11609 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd1d1P11609 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd1d1P11609 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd1d1P11609 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd1d1P11609 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd1d1P11609 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd1d1P11609 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd1d1P11609 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms