Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Schip1P0DPB4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms