Protein–RNA interactions for Protein: P0DN90

Tmem254b, Transmembrane protein 254b, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254bP0DN90 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Tmem254bP0DN90 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmem254bP0DN90 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms