Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb2P0C1T1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb2P0C1T1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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