Protein–RNA interactions for Protein: P09633

Hoxc9, Homeobox protein Hox-C9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc9P09633 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxc9P09633 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Hoxc9P09633 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Hoxc9P09633 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxc9P09633 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxc9P09633 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxc9P09633 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxc9P09633 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxc9P09633 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxc9P09633 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxc9P09633 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxc9P09633 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxc9P09633 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxc9P09633 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms