Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxd3P09027 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd3P09027 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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