Protein–RNA interactions for Protein: P08226

Apoe, Apolipoprotein E, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApoeP08226 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApoeP08226 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApoeP08226 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApoeP08226 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ApoeP08226 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ApoeP08226 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApoeP08226 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms