Protein–RNA interactions for Protein: P06728

Apoa4, Apolipoprotein A-IV, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa4P06728 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms