Protein–RNA interactions for Protein: P04104

Krt1, Keratin, type II cytoskeletal 1, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt1P04104 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt1P04104 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt1P04104 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt1P04104 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt1P04104 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt1P04104 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt1P04104 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt1P04104 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt1P04104 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krt1P04104 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms