Protein–RNA interactions for Protein: P01864

Ig gamma-2A chain C region secreted form, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01864 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01864 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01864 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01864 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01864 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01864 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01864 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
P01864 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01864 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01864 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01864 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01864 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01864 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01864 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
P01864 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01864 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01864 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01864 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01864 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01864 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01864 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01864 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01864 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01864 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01864 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
P01864 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01864 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01864 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01864 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01864 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01864 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01864 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01864 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01864 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01864 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01864 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01864 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01864 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01864 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01864 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01864 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01864 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01864 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01864 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01864 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01864 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01864 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01864 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01864 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01864 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01864 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
P01864 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01864 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01864 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01864 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01864 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01864 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01864 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01864 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01864 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01864 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01864 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01864 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01864 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01864 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01864 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01864 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01864 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01864 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P01864 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P01864 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01864 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P01864 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01864 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01864 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01864 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01864 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01864 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01864 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01864 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01864 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01864 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01864 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01864 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01864 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01864 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
P01864 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01864 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01864 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01864 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01864 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01864 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01864 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01864 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01864 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01864 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01864 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01864 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01864 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01864 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms