Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifnb1P01575 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms