Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vti1bO88384 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vti1bO88384 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vti1bO88384 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vti1bO88384 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vti1bO88384 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vti1bO88384 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vti1bO88384 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vti1bO88384 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vti1bO88384 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vti1bO88384 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vti1bO88384 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vti1bO88384 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vti1bO88384 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vti1bO88384 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vti1bO88384 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vti1bO88384 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vti1bO88384 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vti1bO88384 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vti1bO88384 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vti1bO88384 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vti1bO88384 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vti1bO88384 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vti1bO88384 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vti1bO88384 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vti1bO88384 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vti1bO88384 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vti1bO88384 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vti1bO88384 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vti1bO88384 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vti1bO88384 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vti1bO88384 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vti1bO88384 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vti1bO88384 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vti1bO88384 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vti1bO88384 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vti1bO88384 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vti1bO88384 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vti1bO88384 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vti1bO88384 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vti1bO88384 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vti1bO88384 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vti1bO88384 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vti1bO88384 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vti1bO88384 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms