Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctnnal1O88327 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctnnal1O88327 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctnnal1O88327 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctnnal1O88327 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctnnal1O88327 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctnnal1O88327 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctnnal1O88327 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctnnal1O88327 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctnnal1O88327 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctnnal1O88327 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctnnal1O88327 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctnnal1O88327 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctnnal1O88327 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctnnal1O88327 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctnnal1O88327 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctnnal1O88327 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.5 ms