Protein–RNA interactions for Protein: O70456

Sfn, 14-3-3 protein sigma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfnO70456 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SfnO70456 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SfnO70456 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SfnO70456 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SfnO70456 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SfnO70456 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SfnO70456 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SfnO70456 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SfnO70456 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SfnO70456 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SfnO70456 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SfnO70456 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SfnO70456 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SfnO70456 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SfnO70456 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SfnO70456 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SfnO70456 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SfnO70456 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SfnO70456 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SfnO70456 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SfnO70456 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SfnO70456 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SfnO70456 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SfnO70456 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SfnO70456 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SfnO70456 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SfnO70456 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SfnO70456 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SfnO70456 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SfnO70456 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SfnO70456 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SfnO70456 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SfnO70456 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SfnO70456 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SfnO70456 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SfnO70456 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SfnO70456 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SfnO70456 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SfnO70456 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SfnO70456 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SfnO70456 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SfnO70456 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SfnO70456 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SfnO70456 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SfnO70456 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SfnO70456 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SfnO70456 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SfnO70456 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SfnO70456 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SfnO70456 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SfnO70456 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SfnO70456 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SfnO70456 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SfnO70456 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SfnO70456 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SfnO70456 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SfnO70456 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SfnO70456 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SfnO70456 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SfnO70456 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SfnO70456 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SfnO70456 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SfnO70456 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SfnO70456 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SfnO70456 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SfnO70456 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SfnO70456 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SfnO70456 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SfnO70456 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SfnO70456 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SfnO70456 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SfnO70456 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SfnO70456 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SfnO70456 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SfnO70456 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SfnO70456 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SfnO70456 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SfnO70456 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SfnO70456 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SfnO70456 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SfnO70456 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SfnO70456 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SfnO70456 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SfnO70456 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SfnO70456 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SfnO70456 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SfnO70456 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SfnO70456 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SfnO70456 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SfnO70456 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SfnO70456 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SfnO70456 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SfnO70456 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SfnO70456 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SfnO70456 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SfnO70456 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SfnO70456 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SfnO70456 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SfnO70456 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SfnO70456 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms