Protein–RNA interactions for Protein: O70237

Gfi1b, Zinc finger protein Gfi-1b, mousemouse

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1bO70237 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfi1bO70237 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gfi1bO70237 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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