Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChkbO55229 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChkbO55229 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ChkbO55229 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ChkbO55229 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ChkbO55229 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ChkbO55229 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ChkbO55229 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ChkbO55229 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ChkbO55229 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ChkbO55229 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ChkbO55229 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChkbO55229 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChkbO55229 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChkbO55229 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChkbO55229 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChkbO55229 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChkbO55229 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChkbO55229 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChkbO55229 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChkbO55229 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChkbO55229 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChkbO55229 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChkbO55229 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChkbO55229 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChkbO55229 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChkbO55229 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChkbO55229 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ChkbO55229 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChkbO55229 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChkbO55229 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChkbO55229 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms