Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp2a2O55143 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms