Protein–RNA interactions for Protein: O55142

Rpl35a, 60S ribosomal protein L35a, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35aO55142 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Rpl35aO55142 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Rpl35aO55142 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Rpl35aO55142 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Rpl35aO55142 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Rpl35aO55142 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpl35aO55142 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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