Protein–RNA interactions for Protein: O54967

Tnk2, Activated CDC42 kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnk2O54967 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnk2O54967 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnk2O54967 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnk2O54967 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnk2O54967 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnk2O54967 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnk2O54967 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnk2O54967 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnk2O54967 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnk2O54967 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnk2O54967 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnk2O54967 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnk2O54967 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnk2O54967 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnk2O54967 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnk2O54967 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnk2O54967 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnk2O54967 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnk2O54967 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnk2O54967 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms