Protein–RNA interactions for Protein: O54928

Socs5, Suppressor of cytokine signaling 5, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Socs5O54928 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Socs5O54928 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Socs5O54928 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Socs5O54928 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Socs5O54928 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Socs5O54928 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Socs5O54928 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Socs5O54928 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Socs5O54928 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Socs5O54928 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Socs5O54928 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Socs5O54928 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Socs5O54928 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Socs5O54928 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Socs5O54928 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Socs5O54928 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Socs5O54928 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Socs5O54928 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Socs5O54928 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Socs5O54928 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Socs5O54928 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Socs5O54928 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Socs5O54928 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Socs5O54928 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Socs5O54928 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Socs5O54928 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Socs5O54928 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Socs5O54928 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Socs5O54928 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Socs5O54928 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Socs5O54928 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Socs5O54928 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Socs5O54928 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Socs5O54928 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Socs5O54928 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Socs5O54928 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Socs5O54928 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Socs5O54928 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Socs5O54928 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Socs5O54928 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Socs5O54928 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Socs5O54928 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Socs5O54928 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Socs5O54928 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Socs5O54928 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Socs5O54928 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Socs5O54928 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Socs5O54928 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Socs5O54928 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Socs5O54928 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Socs5O54928 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Socs5O54928 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Socs5O54928 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Socs5O54928 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Socs5O54928 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Socs5O54928 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Socs5O54928 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Socs5O54928 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Socs5O54928 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Socs5O54928 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Socs5O54928 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Socs5O54928 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Socs5O54928 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Socs5O54928 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Socs5O54928 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Socs5O54928 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Socs5O54928 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Socs5O54928 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Socs5O54928 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Socs5O54928 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Socs5O54928 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Socs5O54928 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Socs5O54928 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Socs5O54928 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Socs5O54928 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Socs5O54928 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Socs5O54928 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Socs5O54928 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Socs5O54928 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Socs5O54928 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Socs5O54928 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Socs5O54928 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Socs5O54928 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Socs5O54928 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Socs5O54928 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Socs5O54928 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Socs5O54928 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Socs5O54928 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Socs5O54928 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Socs5O54928 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Socs5O54928 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Socs5O54928 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Socs5O54928 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Socs5O54928 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Socs5O54928 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Socs5O54928 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Socs5O54928 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Socs5O54928 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Socs5O54928 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Socs5O54928 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms