Protein–RNA interactions for Protein: O54689

Ccr6, C-C chemokine receptor type 6, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr6O54689 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccr6O54689 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccr6O54689 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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