Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nedd9O35177 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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Nedd9O35177 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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Nedd9O35177 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nedd9O35177 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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