Protein–RNA interactions for Protein: O35111

Kcnk3, Potassium channel subfamily K member 3, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk3O35111 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Kcnk3O35111 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Kcnk3O35111 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Kcnk3O35111 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Kcnk3O35111 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Kcnk3O35111 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Kcnk3O35111 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Kcnk3O35111 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Kcnk3O35111 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Kcnk3O35111 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Kcnk3O35111 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Kcnk3O35111 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Kcnk3O35111 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnk3O35111 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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