Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gfra2O08842 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms