Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CckarO08786 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CckarO08786 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CckarO08786 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CckarO08786 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CckarO08786 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CckarO08786 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CckarO08786 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CckarO08786 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CckarO08786 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CckarO08786 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CckarO08786 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CckarO08786 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CckarO08786 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CckarO08786 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CckarO08786 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CckarO08786 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CckarO08786 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CckarO08786 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CckarO08786 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CckarO08786 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CckarO08786 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CckarO08786 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CckarO08786 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CckarO08786 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CckarO08786 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CckarO08786 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CckarO08786 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CckarO08786 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CckarO08786 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CckarO08786 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CckarO08786 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CckarO08786 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CckarO08786 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CckarO08786 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CckarO08786 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CckarO08786 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CckarO08786 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CckarO08786 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CckarO08786 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CckarO08786 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CckarO08786 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CckarO08786 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CckarO08786 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CckarO08786 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CckarO08786 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CckarO08786 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CckarO08786 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CckarO08786 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CckarO08786 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CckarO08786 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CckarO08786 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CckarO08786 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CckarO08786 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CckarO08786 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CckarO08786 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CckarO08786 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CckarO08786 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CckarO08786 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CckarO08786 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CckarO08786 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CckarO08786 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CckarO08786 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CckarO08786 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CckarO08786 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CckarO08786 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CckarO08786 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CckarO08786 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CckarO08786 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CckarO08786 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CckarO08786 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CckarO08786 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CckarO08786 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CckarO08786 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CckarO08786 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CckarO08786 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CckarO08786 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CckarO08786 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CckarO08786 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CckarO08786 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CckarO08786 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CckarO08786 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CckarO08786 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CckarO08786 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CckarO08786 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CckarO08786 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CckarO08786 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CckarO08786 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CckarO08786 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CckarO08786 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CckarO08786 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CckarO08786 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CckarO08786 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CckarO08786 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CckarO08786 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CckarO08786 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CckarO08786 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CckarO08786 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CckarO08786 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CckarO08786 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms