Protein–RNA interactions for Protein: O08546

U90926, Putative TNF-resistance related protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U90926O08546 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
U90926O08546 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
U90926O08546 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
U90926O08546 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
U90926O08546 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
U90926O08546 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
U90926O08546 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
U90926O08546 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
U90926O08546 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
U90926O08546 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
U90926O08546 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
U90926O08546 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
U90926O08546 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
U90926O08546 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
U90926O08546 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
U90926O08546 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
U90926O08546 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
U90926O08546 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
U90926O08546 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
U90926O08546 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
U90926O08546 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
U90926O08546 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
U90926O08546 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
U90926O08546 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
U90926O08546 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
U90926O08546 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
U90926O08546 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
U90926O08546 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
U90926O08546 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
U90926O08546 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
U90926O08546 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
U90926O08546 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
U90926O08546 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
U90926O08546 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
U90926O08546 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
U90926O08546 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
U90926O08546 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
U90926O08546 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
U90926O08546 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
U90926O08546 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
U90926O08546 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
U90926O08546 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
U90926O08546 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
U90926O08546 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
U90926O08546 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
U90926O08546 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
U90926O08546 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
U90926O08546 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
U90926O08546 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
U90926O08546 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
U90926O08546 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
U90926O08546 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
U90926O08546 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
U90926O08546 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
U90926O08546 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
U90926O08546 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
U90926O08546 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
U90926O08546 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
U90926O08546 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
U90926O08546 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
U90926O08546 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
U90926O08546 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
U90926O08546 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
U90926O08546 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
U90926O08546 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
U90926O08546 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
U90926O08546 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
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U90926O08546 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
U90926O08546 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
U90926O08546 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
U90926O08546 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
U90926O08546 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
U90926O08546 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
U90926O08546 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
U90926O08546 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
U90926O08546 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
U90926O08546 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
U90926O08546 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
U90926O08546 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
U90926O08546 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
U90926O08546 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
U90926O08546 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
U90926O08546 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
U90926O08546 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
U90926O08546 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
U90926O08546 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
U90926O08546 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
U90926O08546 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
U90926O08546 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
U90926O08546 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
U90926O08546 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
U90926O08546 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
U90926O08546 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
U90926O08546 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
U90926O08546 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
U90926O08546 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
U90926O08546 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
U90926O08546 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
U90926O08546 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms