Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MsmbO08540 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MsmbO08540 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MsmbO08540 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MsmbO08540 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MsmbO08540 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MsmbO08540 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MsmbO08540 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
MsmbO08540 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MsmbO08540 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
MsmbO08540 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MsmbO08540 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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