Protein–RNA interactions for Protein: L7N2C0

Gm6401, Predicted gene 6401 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6401L7N2C0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6401L7N2C0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms