Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Gm5650-201ENSMUST00000209641 598 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 AC132433.1-201ENSMUST00000221553 1101 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Olfr1234-201ENSMUST00000099783 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Gm43216-201ENSMUST00000196295 1333 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Gm22730-201ENSMUST00000158085 171 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 1700029B22Rik-202ENSMUST00000186532 694 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Gm37215-201ENSMUST00000194927 1259 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Cnn3-203ENSMUST00000197135 1242 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 AC153968.2-201ENSMUST00000215579 1140 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Manf-201ENSMUST00000069036 960 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Gm10354-201ENSMUST00000096953 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Gm37389-201ENSMUST00000194885 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Gm5605-201ENSMUST00000208940 1305 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Prl8a8-202ENSMUST00000110350 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Gm22709-201ENSMUST00000116893 111 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Klrc1-203ENSMUST00000118447 684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Gm7350-201ENSMUST00000120964 636 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Gm12811-201ENSMUST00000125237 667 ntTSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms