Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5294J3QP53 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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