Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21976J3QNN2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Gm21976J3QNN2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21976J3QNN2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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