Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Gm17577J3QNF7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Gm17577J3QNF7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Gm17577J3QNF7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Gm17577J3QNF7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Gm17577J3QNF7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm17577J3QNF7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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