Protein–RNA interactions for Protein: J3QM76

Ccdc179, Coiled-coil domain-containing protein 179, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc179J3QM76 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc179J3QM76 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc179J3QM76 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc179J3QM76 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc179J3QM76 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc179J3QM76 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc179J3QM76 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc179J3QM76 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc179J3QM76 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc179J3QM76 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc179J3QM76 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc179J3QM76 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc179J3QM76 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc179J3QM76 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc179J3QM76 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc179J3QM76 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc179J3QM76 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc179J3QM76 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc179J3QM76 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc179J3QM76 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc179J3QM76 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc179J3QM76 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc179J3QM76 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc179J3QM76 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc179J3QM76 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc179J3QM76 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc179J3QM76 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc179J3QM76 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc179J3QM76 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc179J3QM76 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc179J3QM76 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc179J3QM76 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc179J3QM76 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc179J3QM76 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms